Использование Biopython (Python) для извлечения последовательности из файла FASTA ⇐ Python

[Anonymous]

Мне нужно извлечь часть последовательности из файла FASTA, используя Python (biopython, http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html)
Мне нужно получить первые 10 оснований из каждой последовательности и поместить их в один файл, сохранив информацию о последовательности из формата FASTA. В худшем случае я мог бы просто использовать базы, если нет возможности сохранить информацию о последовательности. Вот пример:

Код: Выделить всё

>gi|2765658|emb|Z78533.1|CIZ78533 C.irapeanum 5.8S rRNA gene and ITS1 and ITS2 DNA
CGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGATGAGACCGTGGAATAAACGATCGAGTG
AATCCGGAGGACCGGTGTACTCAGCTCACCGGGGGCATTGCTCCCGTGGTGACCCTGATTTGTTGTTGGG

>gi|2765658|emb|Z78533.1|CIZ78533 C.irapeanum 5.8S rRNA gene and ITS1 and ITS2 DNA
CGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGATGAGACCGTGGAATAAACGATCGAGTG
AATCCGGAGGACCGGTGTACTCAGCTCACCGGGGGCATTGCTCCCGTGGTGACCCTGATTTGTTGTTGGG

>gi|2765658|emb|Z78533.1|CIZ78533 C.irapeanum 5.8S rRNA gene and ITS1 and ITS2 DNA
CGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGATGAGACCGTGGAATAAACGATCGAGTG
AATCCGGAGGACCGGTGTACTCAGCTCACCGGGGGCATTGCTCCCGTGGTGACCCTGATTTGTTGTTGGG

Мне нужен какой-то способ получить первые 10 баз (а затем я планировал сделать это снова для последних 10 баз). Этот сайт с обучающими материалами довольно подробен, но я новичок в этом, и, поскольку об этом не говорится, я даже не уверен, возможно ли это.

Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/131 ... fasta-file