Biopython и доступ к файлу fasta, хранящемуся на компьютере ⇐ Python

[Гость]

реализовать программу на Python, которая включает функцию, которая:

• принимает в качестве входного аргумента имя файла, в котором хранятся белковые последовательности
  Формат FastA.
• из файла считывает последовательности с помощью подходящей функции/метода в пакете
  Biopython и сохраняет их в списке.
• для каждой белковой последовательности используется функция/метод в модуле re для извлечения
  всех неперекрывающихся совпадений для шаблонов, перечисленных ниже. Все непересекающиеся
  совпадения должны быть распечатаны в файле результатов вместе с идентификатором белка, для которого был выполнен поиск шаблона.
  Образцы для поиска:
• W, за которым следует любая аминокислота, за которым следует P
• Два S подряд, за которым следует D или L
• Q, за которым следует одна или две A

Пожалуйста, загрузите фаст-файл с белковыми последовательностями, так как я не могу загрузить свои.
Чтобы найти закономерность, которую я не мог назвать мой фаст-файл


Источник: https://stackoverflow.com/questions/781 ... e-computer