Использование Bio.SeqIO для написания однострочного FASTA ⇐ Python

[Anonymous]

QIIME запрашивает это (здесь) относительно файлов fasta, которые он получает в качестве входных данных:

Код: Выделить всё

The file is a FASTA file, with sequences in the single line format. That is, sequences are not broken up into multiple lines of a particular length, but instead the entire sequence occupies a single line.

Код: Выделить всё

Bio.SeqIO.write

, конечно, следует рекомендациям по формату и разбивает последовательность каждые 80 бит/с.
Я мог бы написать свой собственный писатель для написания этих «однострочных» фастов, но мой вопрос в том, есть ли способ, который я пропустил, чтобы заставить SeqIO сделать это.

Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/241 ... line-fasta