Использование ChEMBL API приводит к ошибке «sqlite3.DatabaseError: образ диска базы данных неверен»Python

Программы на Python
Ответить Пред. темаСлед. тема
Anonymous
 Использование ChEMBL API приводит к ошибке «sqlite3.DatabaseError: образ диска базы данных неверен»

Сообщение Anonymous »

Я использую chembl_webresource_client от ChEMBL. Однако вчера и сегодня все мои запросы, даже базовые, из документа GitHub возвращаются:

sqlite3.DatabaseError: образ диска базы данных неверен
Может ли эта ошибка быть вызвана с моей стороны, и если да, то как с ней бороться? Если нет, то как мне найти другие способы доступа к этой БД?

Код: Выделить всё

import pandas as pd
from chembl_webresource_client.new_client import new_client

activities = new_client.activity.filter(target_chembl_id__in=['CHEMBL5552','CHEMBL1075195']
, pchembl_value__gte=5
, assay_type='B'
).only(['target_chembl_id', 'target_pref_name', 'parent_molecule_chembl_id'
,'molecule_chembl_id','molecule_pref_name', 'pchembl_value'])

act_df = pd.DataFrame(activities)
act_df
Я пробовал изменить ввод, вместо действия использовать метод .molecule, а затем попытался использовать примеры сценариев из документации, но безрезультатно.

Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/789 ... e-is-malfo
Реклама
Ответить Пред. темаСлед. тема

Быстрый ответ

Изменение регистра текста: 
Смайлики
:) :( :oops: :roll: :wink: :muza: :clever: :sorry: :angel: :read: *x)
Ещё смайлики…
   
К этому ответу прикреплено по крайней мере одно вложение.

Если вы не хотите добавлять вложения, оставьте поля пустыми.

Максимально разрешённый размер вложения: 15 МБ.

  • Похожие темы
    Ответы
    Просмотры
    Последнее сообщение

Вернуться в «Python»