Изучаю обработку изображений DICOM и Python. Пожалуйста, ответьте на глупые вопросы.
Я работаю над преобразованием фрагментов изображения CT DICOM в объем, который в дальнейшем можно использовать для отображения в 3D. а также манипулировать дальнейшими уравнениями. Насколько я понимаю, значения пикселей хранятся в заголовке Pixel_array, я не могу понять, как визуализировать объем этих отдельных срезов. Одно из предложений, которое я видел, - это инициализировать пустую матрицу, где vol = матрица размера (ширина пикселя, высота пикселя, срезы ), используя нулевые нули, хотя я понимаю, что ширина пикселя и высота пикселя — это столбцы и строки, которые я могу получить из заголовка DICOM, но не знаю, что такое фрагменты. Кроме того, я нашел следующий код, который дает одинаковый результат в нескольких областях сети, однако не могу указать, где они использовали объем ниже. В конечном итоге мне нужно понять, как я могу получить данные отдельных изображений в матрице трехмерного объема, спасибо: br />https://www.raddq.com/dicom-processing- ... in-python/
def load_scan(path):
slices = [dicom.read_file(path + '/' + s) for s in os.listdir(path)]
slices.sort(key = lambda x: int(x.InstanceNumber))
try:
slice_thickness = np.abs(slices[0].ImagePositionPatient[2] - slices[1].ImagePositionPatient[2])
except:
slice_thickness = np.abs(slices[0].SliceLocation - slices[1].SliceLocation)
for s in slices:
s.SliceThickness = slice_thickness
return slices
def get_pixels_hu(scans):
image = np.stack([s.pixel_array for s in scans])
# Convert to int16 (from sometimes int16),
# should be possible as values should always be low enough (
Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/498 ... -ct-images
