Существуют стандартные способы прогнозирования пропорций, такие как логистическая регрессия (без порогового значения) и бета-регрессия. Об этом уже обсуждалось:
http://scikit-learn-general.narkive.com ... continious -target-variable
http://scikit-learn-general.narkive.com ... -reгрессия
Я не могу сказать, существует ли обходной путь в рамках sklearn.
Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/442 ... proportion