Как настроить итератор в samtools htsjdk?JAVA

Программисты JAVA общаются здесь
Ответить
Anonymous
 Как настроить итератор в samtools htsjdk?

Сообщение Anonymous »

Я использую samtools htsjdk и хочу просмотреть определенный диапазон файла. Я уже знаю местоположение интересующего меня гена и нашел корзину, в которой он находится, но пытаюсь найти способ извлечь конкретную область из файла.
Я пытаюсь сделать это, перебирая файл, пока не доберусь до определенной корзины, но проблема продолжает возникать: «java.lang.IllegalStateException: Итерация выполняется», потому что мне приходится держать SAMReader открытым чтобы создать итератор.

Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/786 ... ols-htsjdk
Ответить

Быстрый ответ

Изменение регистра текста: 
Смайлики
:) :( :oops: :roll: :wink: :muza: :clever: :sorry: :angel: :read: *x)
Ещё смайлики…
   
К этому ответу прикреплено по крайней мере одно вложение.

Если вы не хотите добавлять вложения, оставьте поля пустыми.

Максимально разрешённый размер вложения: 15 МБ.

Вернуться в «JAVA»