Я использую samtools htsjdk и хочу просмотреть определенный диапазон файла. Я уже знаю местоположение интересующего меня гена и нашел корзину, в которой он находится, но пытаюсь найти способ извлечь конкретную область из файла.
Я пытаюсь сделать это, перебирая файл, пока не доберусь до определенной корзины, но проблема продолжает возникать: «java.lang.IllegalStateException: Итерация выполняется», потому что мне приходится держать SAMReader открытым чтобы создать итератор.
Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/786 ... ols-htsjdk
