Я анализирую филогению в IQ-TREE и запустил команду, чтобы получить факторы согласованности генов на корневом дереве. Они были записаны в несколько файлов, включая файл статистики, содержащий разбивку пропорций поддержки gCF, gDF1, gDF2 и gDFp.
Что мне хотелось бы знать, так это то, какой коммутатор ближайшего соседа поддерживается gDF1 или gDF2. По сути, если у меня gDF2 равен 100 (очевидно, это нереально) и я хочу реконструировать свою филогению так, чтобы она содержала эту ветвь вместо ветви в опорном дереве, как мне узнать, какая это альтернативная топология?
Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/798 ... topologies
