Networkx с ошибками из-за добавления узлов и ребер ⇐ Python

[Anonymous]

Это простая программа на Python для создания сетевого графа. Все было хорошо, когда я поместил данные в программу, но когда я решил поместить данные в два входных файла, все стало интересно. Есть два входных файла: узлы (или вершины) и ребра. Когда я прочитал информацию об узлах из входных файлов под названием «Step3-Vertices.txt», это не выдало никакой ошибки, но к узлам была добавлена ​​дополнительная информация, которую я не предоставил. Вот список дополнительной информации:
'[', '{', "'", '0', '2', ',', ' ', '6', '8', 'W', '}', '.', '1', '5', '3', '7', '4', 'O', 'X', 'D', ']', '\n'
Затем я прочитал второй файл под названием «Step3-Edges.txt», на этот раз я получил список сообщений об ошибках.
СООБЩЕНИЯ ОБ ОШИБКАХ — ОШИБКА NETWORKX, КОГДА ИНФОРМАЦИЯ О EDGES ДОБАВЛЕНА ИЗ ФАЙЛА:
Traceback (most recent call last):
File "step4_test1.py", line 30, in
G.add_edges_from(data_edges)
File "/home/desmond/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/networkx/classes/graph.py", line 934, in add_edges_from
"Edge tuple %s must be a 2-tuple or 3-tuple." % (e,))
networkx.exception.NetworkXError: Edge tuple [ must be a 2-tuple or 3-tuple.

Моя программа:
""" THIS PROGRAM WORKS PROPERLY WHEN DATA ARE PASSED TO LOCAL VARIABLES CALLED "nodes" and "edges". THE EXACT DATA ARE ALSO STORED IN TWO FILES: "nodes" in 'Step3-Vertices.txt' and "edges" in 'Step3-Edges.txt'. PROBLEMS STARTED WHEN NODES AND EDGES ARE READ FROM BOTH FILES. FIRST, RUN THIS PROGRAM AND IT SHOULD GENERATE A GRAPH. THEN REPLACE THE "nodes" with "data_nodes" in "G.add_nodes_from" AND THIS WILL GENERATE UNEXPECTED ADDITIONAL NODES WHICH ARE NOT SUPPOSED TO BE THERE. NEXT, REPLACE THE "edges" with "data_edges" in "G.add_nodes_from" AND ERROR MESSAGES ARE DISPLAYED."""

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

""" READ NODES INFORMATION FROM FILE """

with open('Step3-Vertices.txt', encoding='utf-8') as data_file:
data_nodes = data_file.read()

print(data_nodes)

""" READ EDGESS INFORMATION FROM FILE """

with open('Step3-Edges.txt', encoding='utf-8') as data_file:
data_edges = data_file.read()

print(data_edges)

G=nx.Graph()

""" PASS NODES INFORMATION TO A VARIABLE CALLED 'nodes' """

nodes = ['0000000002', '0000000101', '0000000111', '0000000200', '0000000502', '0000000600', '0000001000', '0000001001', '0000001069', '0000001253', '0000001462', '0000003013', '0000003200', '0000004100', '0000004305', '0000005100', '0000005460', '0000006600', '0000010021', '0000010101', '0000010200', '0000010314', '0000012000', '0000012151', '0000012600', '0000015201', '0000016100', '0000017002', '0000020002', '0000020050', '0000020100', '0000021001', '0000022044', '0000022100']

""" PASS EDGES INFORMATION TO A VARIABLE CALLED 'edges' """

edges = [{'0000000002', '6080022W'}, {'80.015.012.210', '0000000002'}, {'80.015.012.210', '0000000502'}, {'0000012000', '0000000502'},{'0000000101', '012.105.123.127'}, {'0000000111', '2442032O'}, {'105.103.02.110', '0000000111'}, {'0604054X', '0000000200'}, {'100.001.008.002', '0000000200'}, {'0000000502', '1002567D'}, {'208.08.032.1', '0000000502'}]

"""THIS IS WHERE YOU ADD DATA TO THE NODES AND EDGES, BY DEFAULT, LOCAL VARIABLES ARE USED. TO ADD DATA FROM THE INPUT FILES - replace 'nodes' with 'data_nodes' and replace 'edges' with 'data_edges' """

G.add_nodes_from(nodes)
G.add_edges_from(edges)

print("Nodes of graph: ")
print(G.nodes())

print("Edges of graph: ")
print(G.edges())

### DRAW A GRAPH ###

nx.draw(G)
plt.savefig("test1.png") # save as png
plt.show() # display


Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/529 ... -and-edges