PyMC + Diffrax: сэмплер MCMC зависает на 0% для иерархической модели PK ODE с серверной частью JAX.Python

Программы на Python
Ответить
Anonymous
 PyMC + Diffrax: сэмплер MCMC зависает на 0% для иерархической модели PK ODE с серверной частью JAX.

Сообщение Anonymous »

Проблема
Я реализую иерархическую фармакокинетическую (PK) модель в PyMC, используя Diffrax для решения ОДУ через оболочку icomo.jax2pytensor. Модель успешно компилируется и инициализируется, но Выборка MCMC зависает на неопределенный срок при прогрессе 0% как с сэмплерами NumPyro, так и с BlackJAX.

Код: Выделить всё

Running chain 0:   0%| | 0/2000 [03:51

Подробнее здесь: [url]https://stackoverflow.com/questions/79863500/pymc-diffrax-mcmc-sampler-hangs-at-0-for-hierarchical-pk-ode-model-with-jax[/url]
Ответить

Быстрый ответ

Изменение регистра текста: 
Смайлики
:) :( :oops: :roll: :wink: :muza: :clever: :sorry: :angel: :read: *x)
Ещё смайлики…
   
К этому ответу прикреплено по крайней мере одно вложение.

Если вы не хотите добавлять вложения, оставьте поля пустыми.

Максимально разрешённый размер вложения: 15 МБ.

Вернуться в «Python»