У меня есть список из более чем 2000 белков,
около 100 из них имеют устаревшие идентификаторы белка, которые я хочу обновить с помощью новых идентификаторов. У меня есть их имена генов,
, и мне интересно, выполнится ли это. использовал данные Genpept и смог сузить список вниз (100). < /p>
< /li>
Я обнаружил, что некоторые из них являются именами генов (не белков), поэтому я попытался использовать старые исторические данные для их карты, но я не был успешным. Идентификаторы на веб -странице гена NCBI, но я не мог приступить к работе. Loc148206, flj32743, loc644890, loc387755, loc150356, flj35808, mgc10433, loc142910, hcg_1794298, loc643226, loc151871, loc790955, flj100944207, loc151871, loc790955, flj100944207, loc151871, loc790955, flj RP11-544M22.4, LOC649055, FLJ44815, LOC143241, FLJ45235, FLJ39660, LOC90485, LOC51234, FLJ43582, LOC497661, FLJ13352, MGC21675, LOC41844444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 FLJ12572, FLJ23018, FLJ20847, LOC220929, FLJ45717, FLJ44290, FLJ25811, LOC143678, LOC65243, LOC441376, LOC100132247, LOC253982, LOC100132832, LOC388888, LOC253982, LOC10013282, LOC3888888888888888, loc253982, loc100132828888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888н LOC442582, LOC284307, LOC388799, FLJ22184, LOC388650, FLJ20245, LOC131149, FLJ38819, LOC80298, FLJ10997, LOC285148, LOC644414, FLJ40452, MGC15668, LOC387733, LOC441061, LOC163590, LOC441161, LOC645432, LOC114990, FLJ12847, LOC729440, FLJ21934, FLJ13150, LOC254359, LOC728656, LOC150786, MGC3794, LOC255783, FLJ45032, Loc389118, flj14154, flj22374, mgc33947, loc400746, mgc16279, loc387923, loc152573, loc100131897, pp8961, loc132671, loc65591, mgc33212, loc132671, loc65591, mgc33212, loc132671, loc65591, mgc33212, loc132671, loc65591, mgc33212, loc132671, loc65591, p DKFZP434C171, LOC90525, MGC40397, LOC387775, LOC390231, LOC129881, LOC284021, FLJ21438, LOC100130958, LOC283677, LOC653483, LOC152877, MGC40042, LOC342933, Loc84643, loc51161, flj45557, loc152138, 3phexo, loc339210, loc730394, loc400566, flj12528, loc51257, flj30726, loc440836, loc338661, loc375759, Loc440836, loc338661, loc375759, loc440836, loc338661, loc375759, loc440836, loc338661, loc375959, loc440836, loc338661, loc375759, loc440836, loc338661, loc51257. Loc255743, loc220416, flj32115, flj23588, loc646174, loc117588 < /p>
Вот код, который я попробовал: < /p>
library(rvest)
library(readxl)
library(openxlsx)
library(dplyr)
unmapped_df
Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/797 ... out-an-api
