Я пытаюсь воспроизвести биплат PCA, где
dots = образцы, окрашенные образец столбца в pb.obs и
стрелки = гены, указывая на область (s) на графике, где каждый ген наиболее высоко экспрессирован. Pd.x < /code> < /p>
Итак - если ген связан с определенной выборкой, на графике PCA направление стрелки будет направлено на эту выборку.
Если ген высокий в двух образцах, я ожидаю, что стрелка окажется между двумя областями образцов; Если он высокий в трех моделях, стрелка должна измениться соответственно .. и т. Д. Пример фото, который я сделал из Google, прекрасно показывает, что мне нужно:
Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/796 ... th-samples
PCA со стрелками направления, показывающими гены, связанные с образцами ⇐ Python
-
- Похожие темы
- Ответы
- Просмотры
- Последнее сообщение
-
-
PCA со стрелками направления, показывающими гены, связанные с образцами
Anonymous » » в форуме Python - 0 Ответы
- 2 Просмотры
-
Последнее сообщение Anonymous
-
-
-
PCA со стрелками направления, показывающими гены, связанные с образцами [закрыто]
Anonymous » » в форуме Python - 0 Ответы
- 2 Просмотры
-
Последнее сообщение Anonymous
-
-
-
PCA со стрелками направления, показывающими гены, связанные с образцами
Anonymous » » в форуме Python - 0 Ответы
- 2 Просмотры
-
Последнее сообщение Anonymous
-