У меня есть два файла, разделенных вкладками (с тысячей строк каждый): < /p>
file1: < /p>
anno1.g20653.t1 anno1.g20674.t1 eud1g02416 eud1g02458 27 +
anno2.g3796.t1 anno1.g20698.t1 eud1g02520 eud1g02556 28 +
< /code>
file2: < /p>
scaffold_1 transcript 11256 13613 anno1.g20653.t1
scaffold_1 transcript 25598 47989 anno1.g20066.t2
< /code>
Я хотел бы сделать следующее: если элемент в столбце 1 File1 Существует в столбце 5 File2, печатайте выходной файл3 с двумя соответствующими строками комбинированными (вкладка), игнорируя строки без совпадений: < /p>
file3: < /p>
anno1.g20653.t1 anno1.g20674.t1 eud1g02416 eud1g02458 27 + scaffold_1 transcript 11256 13613 anno1.g20653.t1
< /code>
Я попробовал следующее, но она только извлекает строку из файла2: < /p>
awk 'FNR==NR {a[$1]; next} FNR> 1 && $5 in a' File1 File2 > File3
< /code>
Awk или Python Code был бы полезен. Спасибо.
Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/796 ... cific-colu
Извлечение строк из двух файлов, где в определенных столбцах есть соответствие значения ⇐ Python
-
- Похожие темы
- Ответы
- Просмотры
- Последнее сообщение
-
-
Извлечение строк из двух файлов, где в определенных столбцах есть соответствие значения
Anonymous » » в форуме Python - 0 Ответы
- 2 Просмотры
-
Последнее сообщение Anonymous
-
-
-
Извлечение строк из двух файлов, где в определенных столбцах есть соответствие значения
Anonymous » » в форуме Python - 0 Ответы
- 3 Просмотры
-
Последнее сообщение Anonymous
-
-
-
Извлечение строк из двух файлов, где в определенных столбцах есть соответствие значения
Anonymous » » в форуме Python - 0 Ответы
- 3 Просмотры
-
Последнее сообщение Anonymous
-
-
-
Извлечение строк из двух файлов, где в определенных столбцах есть соответствие значения
Anonymous » » в форуме Python - 0 Ответы
- 4 Просмотры
-
Последнее сообщение Anonymous
-
-
-
Извлечение строк из двух файлов, где в определенных столбцах есть соответствие значения
Anonymous » » в форуме Python - 0 Ответы
- 2 Просмотры
-
Последнее сообщение Anonymous
-