Извлечение строк из двух файлов, где в определенных столбцах есть соответствие значенияPython

Программы на Python
Ответить Пред. темаСлед. тема
Anonymous
 Извлечение строк из двух файлов, где в определенных столбцах есть соответствие значения

Сообщение Anonymous »

У меня есть два файла, разделенных вкладками (с тысячей строк каждый): < /p>
file1: < /p>
anno1.g20653.t1 anno1.g20674.t1 eud1g02416 eud1g02458 27 +
anno2.g3796.t1 anno1.g20698.t1 eud1g02520 eud1g02556 28 +
< /code>
file2: < /p>
scaffold_1 transcript 11256 13613 anno1.g20653.t1
scaffold_1 transcript 25598 47989 anno1.g20066.t2
< /code>
Я хотел бы сделать следующее: если элемент в столбце 1 File1 Существует в столбце 5 File2, печатайте выходной файл3 с двумя соответствующими строками комбинированными (вкладка), игнорируя строки без совпадений: < /p>
file3: < /p>
anno1.g20653.t1 anno1.g20674.t1 eud1g02416 eud1g02458 27 + scaffold_1 transcript 11256 13613 anno1.g20653.t1
< /code>
Я попробовал следующее, но она только извлекает строку из файла2: < /p>
awk 'FNR==NR {a[$1]; next} FNR> 1 && $5 in a' File1 File2 > File3
< /code>
Awk или Python Code был бы полезен. Спасибо.

Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/796 ... cific-colu
Реклама
Ответить Пред. темаСлед. тема

Быстрый ответ

Изменение регистра текста: 
Смайлики
:) :( :oops: :roll: :wink: :muza: :clever: :sorry: :angel: :read: *x)
Ещё смайлики…
   
К этому ответу прикреплено по крайней мере одно вложение.

Если вы не хотите добавлять вложения, оставьте поля пустыми.

Максимально разрешённый размер вложения: 15 МБ.

  • Похожие темы
    Ответы
    Просмотры
    Последнее сообщение

Вернуться в «Python»