Ошибка FontConfig при запуске сценария NextFlowPython

Программы на Python
Ответить Пред. темаСлед. тема
Anonymous
 Ошибка FontConfig при запуске сценария NextFlow

Сообщение Anonymous »

Я запускаю скрипт Nextflow Nextflow с изображением Docker, преобразованным через Apptainger.

Код: Выделить всё

nextflow run main.nf -c nextflow.config \
--fastq /rds/projects/b/Anu/pilot_data/EBT_U2OS_15112023/output/EBT_HP_chr22.fq \
--skipmapping -profile apptainer
< /code>
При запуске скрипт бросает следующую ошибку < /p>
Matplotlib created a temporary cache directory at
/tmp/matplotlib-d2xaw8he because the default path
(/rds/homes/d/dasaz/.config/matplotlib) is not a writable directory;
it is highly recommended to set the MPLCONFIGDIR environment variable
to a writable directory, in particular to speed up the import of Matplotlib
and to better support multiprocessing.

Fontconfig error: No writable cache directories
Я обновил переменные mplconfigdir xdg_cache_home , но скрипт выбрасывает ошибку. Я проверил, что каталоги .config/matplotlib (также каталоги, которые я указал)>

Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/796 ... low-script
Реклама
Ответить Пред. темаСлед. тема

Быстрый ответ

Изменение регистра текста: 
Смайлики
:) :( :oops: :roll: :wink: :muza: :clever: :sorry: :angel: :read: *x)
Ещё смайлики…
   
К этому ответу прикреплено по крайней мере одно вложение.

Если вы не хотите добавлять вложения, оставьте поля пустыми.

Максимально разрешённый размер вложения: 15 МБ.

  • Похожие темы
    Ответы
    Просмотры
    Последнее сообщение
  • Ошибка FontConfig при запуске сценария NextFlow
    Anonymous » » в форуме Python
    0 Ответы
    4 Просмотры
    Последнее сообщение Anonymous
  • Ошибка FontConfig при запуске сценария NextFlow
    Anonymous » » в форуме Python
    0 Ответы
    3 Просмотры
    Последнее сообщение Anonymous
  • Ошибка импорта модулей Python в блоке сценария nextflow
    Anonymous » » в форуме Python
    0 Ответы
    10 Просмотры
    Последнее сообщение Anonymous
  • Ошибка импорта модулей Python в блоке сценария nextflow
    Anonymous » » в форуме Python
    0 Ответы
    16 Просмотры
    Последнее сообщение Anonymous
  • Ошибка импорта модулей Python в блоке сценария nextflow
    Anonymous » » в форуме Python
    0 Ответы
    8 Просмотры
    Последнее сообщение Anonymous

Вернуться в «Python»