SnakeMake Access snakemake.config в профиле config.yaml файл ⇐ Python

[Anonymous]

Я хочу запустить конвейер на кластере, где имя заданий имеет форму: smk- {config ["simulation"]}-{rule}-{wildcards} . Могу ли я просто сделать: < /p>
snakemake --profile slurm --configfile myconfig.yaml

с slurm/config.yaml wee:
executor: slurm
jobs: 64
latency-wait: 30
cluster:
sbatch
--partition=workq
--job-name=smk-{config["simulation"]}-{rule}-{wildcards}
[...]


Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/795 ... -yaml-file