KeyError при использовании sc.pl.patial в Scanpy: «Изображения» не найдены в пространственных данныхPython

Программы на Python
Ответить Пред. темаСлед. тема
Anonymous
 KeyError при использовании sc.pl.patial в Scanpy: «Изображения» не найдены в пространственных данных

Сообщение Anonymous »

В настоящее время я работаю с анализом пространственных данных, используя Scanpy и пытаюсь визуализировать мои данные, используя SC.PL.Patial Function. Тем не менее, я столкнулся с KeeError при попытке указать параметр Library_id как «изображения». Вот фрагмент кода, который я использую: < /p>
import matplotlib.pyplot as plt
import scanpy as sc

plt.rcParams["figure.figsize"] = (8, 8)
sc.pl.spatial(adata, img_key="hires", color=["total_counts", "n_genes_by_counts"], library_id='images')
< /code>
KeyError: 'images'
< /code>
I understand that this error occurs because the 'images' key is not found in the spatial data. However, I'm unsure why this key is missing or how to resolve this issue.
Here's what I've tried so far:
Checked the contents of adata.uns to confirm that 'images' is indeed present.
Verified that the data I'm working with contains spatial information and images.
Double-checked the documentation for sc.pl.spatial and adata.uns to ensure I'm using the correct parameters.
Could someone please help me understand why this KeyError is occurring and how I can resolve it? Any insights or suggestions would be greatly appreciated. Thank you!

Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/779 ... atial-data
Реклама
Ответить Пред. темаСлед. тема

Быстрый ответ

Изменение регистра текста: 
Смайлики
:) :( :oops: :roll: :wink: :muza: :clever: :sorry: :angel: :read: *x)
Ещё смайлики…
   
К этому ответу прикреплено по крайней мере одно вложение.

Если вы не хотите добавлять вложения, оставьте поля пустыми.

Максимально разрешённый размер вложения: 15 МБ.

  • Похожие темы
    Ответы
    Просмотры
    Последнее сообщение
  • Как изменить размер шрифта в Scanpy
    Anonymous » » в форуме Python
    0 Ответы
    5 Просмотры
    Последнее сообщение Anonymous
  • Как процедура обучения и тестирование работает при применении сети пространственных преобразований
    Anonymous » » в форуме Python
    0 Ответы
    2 Просмотры
    Последнее сообщение Anonymous
  • Кластеризируйте людей на основе пространственных координат с ограничениями.
    Anonymous » » в форуме Python
    0 Ответы
    28 Просмотры
    Последнее сообщение Anonymous
  • Преобразование пространственных координат
    Anonymous » » в форуме Python
    0 Ответы
    19 Просмотры
    Последнее сообщение Anonymous
  • Кригинг пространственных координат через REST API
    Anonymous » » в форуме Python
    0 Ответы
    5 Просмотры
    Последнее сообщение Anonymous

Вернуться в «Python»