Добавьте новые реакции с помощью георадара ⇐ Python

[Anonymous]

У меня есть модель, и я хочу добавить к ней совершенно новый путь. Некоторые метаболиты уже существуют в модели, другие еще предстоит создать. Мне также нужно добавить GPR к реакциям, используя гены, еще не присутствующие в модели.

Я нашел функцию addReaction, но всегда получаю ошибку, когда я используйте его:

Код: Выделить всё

import cbmpy

cmod = cbmpy.CBRead.readSBML3FBC('model.xml')

cmod.addReaction('R_foo')

AssertionError: ОШИБКА: требуется объект Reaction, а не что-то типа
< /p>


Есть идеи, как я могу передать объект реакции и добавить метаболиты и георадар?>

Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/507 ... s-with-gpr