Итак, моя цель — помочь группе биологов использовать библиотеку Python через язык R, потому что они знают только этот язык. Библиотека scSpectra, это не совсем обычная библиотека. Им нужны еще несколько библиотек, например pyvis и rpy2.
Существует библиотека R (сетчатая), которая позволяет использовать скрипты и библиотеки Python. Цель состоит в том, чтобы биологи установили среду Python на свой компьютер, а затем использовали reticulate в R для вызова библиотеки scSpectra.
У меня возникли проблемы с установкой scSpectra на моем компьютере, поэтому я думаю, что просить биологов установить библиотеки не получится.
Итак, как лучше всего легко поделиться средой Python?
Я пытался создать venv на Python, но вот до чего дошло неправильный. Установка с помощью pip rpy2 и pyvis прошла хорошо, но когда я пытаюсь установить scSpectra, что-то идет не так с установкой numpy (scSpectra требует определенного диапазона версий). Я не нашел, как решить эту проблему.
Затем я попытался создать среду conda, но у меня все еще возникли проблемы с загрузкой numpy, которые мне удалось решить на этот раз. Я не знаю, смогу ли я каким-либо образом поделиться этой средой...
Моя последняя догадка — использовать docker, но я никогда им не пользовался, поэтому не знаю. если она совместима с «сетчатой» библиотекой R.
Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/793 ... nvironment
Как проще всего поделиться средой Python? ⇐ Python
Программы на Python
1734969551
Anonymous
Итак, моя цель — помочь группе биологов использовать библиотеку Python через язык R, потому что они знают только этот язык. Библиотека scSpectra, это не совсем обычная библиотека. Им нужны еще несколько библиотек, например pyvis и rpy2.
Существует библиотека R (сетчатая), которая позволяет использовать скрипты и библиотеки Python. Цель состоит в том, чтобы биологи установили среду Python на свой компьютер, а затем использовали reticulate в R для вызова библиотеки scSpectra.
У меня возникли проблемы с установкой scSpectra на моем компьютере, поэтому я думаю, что просить биологов установить библиотеки не получится.
Итак, как лучше всего легко поделиться средой Python?
Я пытался создать venv на Python, но вот до чего дошло неправильный. Установка с помощью pip rpy2 и pyvis прошла хорошо, но когда я пытаюсь установить scSpectra, что-то идет не так с установкой numpy (scSpectra требует определенного диапазона версий). Я не нашел, как решить эту проблему.
Затем я попытался создать среду conda, но у меня все еще возникли проблемы с загрузкой numpy, которые мне удалось решить на этот раз. Я не знаю, смогу ли я каким-либо образом поделиться этой средой...
Моя последняя догадка — использовать docker, но я никогда им не пользовался, поэтому не знаю. если она совместима с «сетчатой» библиотекой R.
Подробнее здесь: [url]https://stackoverflow.com/questions/79303599/what-is-the-easiest-way-to-share-a-python-environment[/url]
Ответить
1 сообщение
• Страница 1 из 1
Перейти
- Кемерово-IT
- ↳ Javascript
- ↳ C#
- ↳ JAVA
- ↳ Elasticsearch aggregation
- ↳ Python
- ↳ Php
- ↳ Android
- ↳ Html
- ↳ Jquery
- ↳ C++
- ↳ IOS
- ↳ CSS
- ↳ Excel
- ↳ Linux
- ↳ Apache
- ↳ MySql
- Детский мир
- Для души
- ↳ Музыкальные инструменты даром
- ↳ Печатная продукция даром
- Внешняя красота и здоровье
- ↳ Одежда и обувь для взрослых даром
- ↳ Товары для здоровья
- ↳ Физкультура и спорт
- Техника - даром!
- ↳ Автомобилистам
- ↳ Компьютерная техника
- ↳ Плиты: газовые и электрические
- ↳ Холодильники
- ↳ Стиральные машины
- ↳ Телевизоры
- ↳ Телефоны, смартфоны, плашеты
- ↳ Швейные машинки
- ↳ Прочая электроника и техника
- ↳ Фототехника
- Ремонт и интерьер
- ↳ Стройматериалы, инструмент
- ↳ Мебель и предметы интерьера даром
- ↳ Cантехника
- Другие темы
- ↳ Разное даром
- ↳ Давай меняться!
- ↳ Отдам\возьму за копеечку
- ↳ Работа и подработка в Кемерове
- ↳ Давай с тобой поговорим...
Мобильная версия