Среда Conda с SLURMPython

Программы на Python
Ответить
Anonymous
 Среда Conda с SLURM

Сообщение Anonymous »

Я пытаюсь выполнить скрипт Python в среде conda в кластере SLURM. До сих пор любые предложения, которые я нашел в Интернете, не могли решить мою проблему. Я настроил среду conda и установил все необходимые пакеты. Для простоты предположим, что мой скрипт Python содержит только факел импорта строк. Необходимые пакеты установлены в среде (скрипт работает без проблем на моем локальном компьютере). Я установил Miniconda, если это важно.
Мой файл bash содержит после #!/bin/sh и нескольких команд #SBATCH следующие строки:

Код: Выделить всё

source /path/to/.bashrc
conda activate myenv

python3 /path/to/test.py
Но затем я получаю сообщение об ошибке, что файл .bashrc не существует.
Если я удалю строки

Код: Выделить всё

source /path/to/.bashrc
conda activate myenv
и выполните файл bash из активированной среды myenv. Я получаю сообщение об ошибке, что он не может найти модуль torch....
Любая помощь буду признателен...

Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/777 ... with-slurm
Ответить

Быстрый ответ

Изменение регистра текста: 
Смайлики
:) :( :oops: :roll: :wink: :muza: :clever: :sorry: :angel: :read: *x)
Ещё смайлики…
   
К этому ответу прикреплено по крайней мере одно вложение.

Если вы не хотите добавлять вложения, оставьте поля пустыми.

Максимально разрешённый размер вложения: 15 МБ.

Вернуться в «Python»