Использование rpy2 для доступа к пакетам R в PythonPython

Программы на Python
Ответить Пред. темаСлед. тема
Anonymous
 Использование rpy2 для доступа к пакетам R в Python

Сообщение Anonymous »

Гуру/коллеги-энтузиасты!
Я использую rpy2 для доступа к функциям R в Python. И возникли проблемы с вызовом функции под названием «seas», которая находится в «сезонном» пакете R. (через блокнот Jupyter в Windows 10)
ts_r = robjects.r('ts')
input_5 = ts_r(series.values, frequency=12, start=2001)
is_ts_r(input_5) # get TRUE for this function which checks for 'ts' object
seas_r = robjects.r('seas')
model = seas_r(input_5) # this line gives **ERROR**

Чтобы проверить правильность установки пакета, я выполнил следующий тест, и он оказался успешным.
output_r = robjects.r('seas(AirPassengers)') # can view output for air passenger data (pre-defined in R)

Я провел еще один тест, чтобы проверить объект «ts», созданный в Python. Я вызвал другую функцию под названием «stl» в пакете R «stats», которая использует объект «ts», и она работает.
stl_r = robjects.r('stl')
output_model_stl = stl_r(input_5, "periodic") # ** THIS WORKS**

Я включил ошибку ниже для удобства чтения.
Буду признателен за любые предложения по устранению проблемы.
model = seas_r(input_5)

R[write to console]: Error in align_x_list(x, list) :
all(sapply(x, inherits, "ts")) is not TRUE

---------------------------------------------------------------------------
RRuntimeError Traceback (most recent call last)
~\AppData\Local\Temp/ipykernel_25148/2372710267.py in
----> 1 model = seas_r(input_5)

c:\python39\lib\site-packages\rpy2\robjects\functions.py in __call__(self, *args, **kwargs)
196 v = kwargs.pop(k)
197 kwargs[r_k] = v
--> 198 return (super(SignatureTranslatedFunction, self)
199 .__call__(*args, **kwargs))
200

c:\python39\lib\site-packages\rpy2\robjects\functions.py in __call__(self, *args, **kwargs)
123 else:
124 new_kwargs[k] = conversion.py2rpy(v)
--> 125 res = super(Function, self).__call__(*new_args, **new_kwargs)
126 res = conversion.rpy2py(res)
127 return res

c:\python39\lib\site-packages\rpy2\rinterface_lib\conversion.py in _(*args, **kwargs)
43 def _cdata_res_to_rinterface(function):
44 def _(*args, **kwargs):
---> 45 cdata = function(*args, **kwargs)
46 # TODO: test cdata is of the expected CType
47 return _cdata_to_rinterface(cdata)

c:\python39\lib\site-packages\rpy2\rinterface.py in __call__(self, *args, **kwargs)
678 )
679 if error_occured[0]:
--> 680 raise embedded.RRuntimeError(_rinterface._geterrmessage())
681 return res
682

RRuntimeError: Error in align_x_list(x, list) :
all(sapply(x, inherits, "ts")) is not TRUE


Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/709 ... -in-python
Реклама
Ответить Пред. темаСлед. тема

Быстрый ответ

Изменение регистра текста: 
Смайлики
:) :( :oops: :roll: :wink: :muza: :clever: :sorry: :angel: :read: *x)
Ещё смайлики…
   
К этому ответу прикреплено по крайней мере одно вложение.

Если вы не хотите добавлять вложения, оставьте поля пустыми.

Максимально разрешённый размер вложения: 15 МБ.

  • Похожие темы
    Ответы
    Просмотры
    Последнее сообщение

Вернуться в «Python»