Snakemake не может выполнить преамп при выполнении --edit-notebook внутри виртуального окружения.Python

Программы на Python
Ответить
Anonymous
 Snakemake не может выполнить преамп при выполнении --edit-notebook внутри виртуального окружения.

Сообщение Anonymous »

У меня есть блокнот пакетов Python и Snakemake, установленный в моих пользовательских сайтах.
Чтобы использовать Snakemake с различными настройками, я использую virtualenvs. В этом виртуальном окружении я установил Snakemake и все требования моего рабочего процесса.
Когда я пытаюсь редактировать блокнот с помощью
snakemake --cores 1 --edit-notebook

откроется сервер блокнота, и я смогу редактировать блокнот. Но когда я пытаюсь выполнить преамбулу Snakemake (первая ячейка, которая автоматически вставляется Snakemake), я получаю следующую ошибку:
AttributeError: Can't get attribute 'AttributeGuard' on

Это странно, потому что в моем виртуальном окружении установлен Snakemake:
$ which snakemake
~/.virtualenvs//bin/snakemake


Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/791 ... k-inside-a
Ответить

Быстрый ответ

Изменение регистра текста: 
Смайлики
:) :( :oops: :roll: :wink: :muza: :clever: :sorry: :angel: :read: *x)
Ещё смайлики…
   
К этому ответу прикреплено по крайней мере одно вложение.

Если вы не хотите добавлять вложения, оставьте поля пустыми.

Максимально разрешённый размер вложения: 15 МБ.

Вернуться в «Python»