Функции разреженной матрицы SciPy csr_matrix и csc_matrix – сколько промежуточной памяти они используют?Python

Программы на Python
Ответить Пред. темаСлед. тема
Anonymous
 Функции разреженной матрицы SciPy csr_matrix и csc_matrix – сколько промежуточной памяти они используют?

Сообщение Anonymous »

Для функций scipy csr_matrix и csc_matrix, а также, в частности, форм, которые принимают индексы строк и столбцов:
csr_matrix((data, (row_ind, col_ind)), [shape=(M, N)])
csc_matrix((data, (row_ind, col_ind)), [shape=(M, N)])

Какой объем промежуточной памяти они используют? Предположительно, им приходится использовать некоторые из них для преобразования в представления CSR/CSC.
Контекст таков, что вызов этих функций в конкретном случае использует много памяти, вплоть до такой степени, что не удалось, потому что ему не хватает памяти, поэтому я пытаюсь рассуждать об этом. Всего data + row_ind + col_ind в моем конкретном примере занимает 25 ГБ, и у меня остается около 35 ГБ памяти, но этого недостаточно для вызова csr_matrix или csc_matrix.
Документация по адресу https://docs.scipy.org/doc/scipy/refere ... atrix.html и https://docs.scipy.org/doc/scipy/refere ... csc_matrix. html, кажется, не дает информации по этому поводу.
Вот, я надеюсь, примерно эквивалентный фрагмент кода, которому не хватает памяти в моей системе с 60 ГБ (Linux).
import numpy as np
from scipy.sparse import csc_matrix

num_values = 2500000000
output_matrix_size = 150000

matrix = csc_matrix(
(
np.zeros(num_values, dtype=np.float16),
(
np.zeros(num_values, dtype=np.int32),
np.zeros(num_values, dtype=np.int32),
),
),
shape=(output_matrix_size, output_matrix_size),
)


Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/791 ... termediate
Реклама
Ответить Пред. темаСлед. тема

Быстрый ответ

Изменение регистра текста: 
Смайлики
:) :( :oops: :roll: :wink: :muza: :clever: :sorry: :angel: :read: *x)
Ещё смайлики…
   
К этому ответу прикреплено по крайней мере одно вложение.

Если вы не хотите добавлять вложения, оставьте поля пустыми.

Максимально разрешённый размер вложения: 15 МБ.

  • Похожие темы
    Ответы
    Просмотры
    Последнее сообщение

Вернуться в «Python»