Я хочу добавить в массив, как в список из цикла for, но для этого мне нужно сначала создать пустой массив и добавить к нему. Каждое предложение, которое я видел на этом сайте, приводит к перезаписыванию старого массива новым, что кажется невероятно глупым. Размер файла, который я извлекаю, составляет 150 x 180 000 точек данных, поэтому списки его не обрежут. Кажется безумием, что создание пустого массива — невыполнимая задача, если составить список так просто.
На данный момент это мой код, но я хочу исключить список из уравнения
р>
from Bio import SeqIO
from Bio.SeqUtils import gc_fraction
import matplotlib.pyplot as plt
import gzip
import numpy as np
with gzip.open("data.fastq.gz",'rt') as input_file:
sio = SeqIO.parse(input_file, "fastq")
numdata = []
for r in sio:
numdata.append(r.letter_annotations['phred_quality'])
npa = np.array(numdata)
plt.boxplot(npa,showfliers = False)
plt.title("Quality Score Boxplot")
plt.xlabel("Number of Basepairs")
plt.ylabel("Number of Reads")
plt.show()
Подробнее здесь: https://stackoverflow.com/questions/790 ... writing-it
Создание пустого массива БЕЗ его перезаписи ⇐ Python
Программы на Python
-
Anonymous
1727496237
Anonymous
Я хочу добавить в массив, как в список из цикла for, но для этого мне нужно сначала создать пустой массив и добавить к нему. Каждое предложение, которое я видел на этом сайте, приводит к перезаписыванию старого массива новым, что кажется невероятно глупым. Размер файла, который я извлекаю, составляет 150 x 180 000 точек данных, поэтому списки его не обрежут. Кажется безумием, что создание пустого массива — невыполнимая задача, если составить список так просто.
На данный момент это мой код, но я хочу исключить список из уравнения
р>
from Bio import SeqIO
from Bio.SeqUtils import gc_fraction
import matplotlib.pyplot as plt
import gzip
import numpy as np
with gzip.open("data.fastq.gz",'rt') as input_file:
sio = SeqIO.parse(input_file, "fastq")
numdata = []
for r in sio:
numdata.append(r.letter_annotations['phred_quality'])
npa = np.array(numdata)
plt.boxplot(npa,showfliers = False)
plt.title("Quality Score Boxplot")
plt.xlabel("Number of Basepairs")
plt.ylabel("Number of Reads")
plt.show()
Подробнее здесь: [url]https://stackoverflow.com/questions/79016605/making-an-empty-array-without-overwriting-it[/url]
Ответить
1 сообщение
• Страница 1 из 1
Перейти
- Кемерово-IT
- ↳ Javascript
- ↳ C#
- ↳ JAVA
- ↳ Elasticsearch aggregation
- ↳ Python
- ↳ Php
- ↳ Android
- ↳ Html
- ↳ Jquery
- ↳ C++
- ↳ IOS
- ↳ CSS
- ↳ Excel
- ↳ Linux
- ↳ Apache
- ↳ MySql
- Детский мир
- Для души
- ↳ Музыкальные инструменты даром
- ↳ Печатная продукция даром
- Внешняя красота и здоровье
- ↳ Одежда и обувь для взрослых даром
- ↳ Товары для здоровья
- ↳ Физкультура и спорт
- Техника - даром!
- ↳ Автомобилистам
- ↳ Компьютерная техника
- ↳ Плиты: газовые и электрические
- ↳ Холодильники
- ↳ Стиральные машины
- ↳ Телевизоры
- ↳ Телефоны, смартфоны, плашеты
- ↳ Швейные машинки
- ↳ Прочая электроника и техника
- ↳ Фототехника
- Ремонт и интерьер
- ↳ Стройматериалы, инструмент
- ↳ Мебель и предметы интерьера даром
- ↳ Cантехника
- Другие темы
- ↳ Разное даром
- ↳ Давай меняться!
- ↳ Отдам\возьму за копеечку
- ↳ Работа и подработка в Кемерове
- ↳ Давай с тобой поговорим...
Мобильная версия